Новое и
полезное

Новая система компьютерного моделирования предсказывает реакцию ВИЧ-инфицированных пациентов на лечение

Новая система компьютерного моделирования, разработанная британской исследовательской группой RDI, способна предсказать реакцию ВИЧ-инфицированных пациентов на лечение определенными лекарствами. Система, названная авторами HIV-TRePS (от англ. «система предсказания реакции на лечение ВИЧ»), находится в свободном доступе в сети интернет. В HIV-TRePS использована компьютерная модель, «обученная» с использованием данных о десятках тысяч пациентов, проходивших лечение в больницах по всему миру. Врачи могут ввести в систему данные о своих пациентах, и система предскажет, как конкретный пациент может отреагировать на каждую из сотен возможных комбинаций лекарств от ВИЧ. Всего за несколько секунд врач получит список комбинаций лекарств, которые, согласно предсказаниям модели, имеют наибольший шанс на успех для данного пациента. Таким образом, удастся уменьшить число подбираемых комбинаций и, соответственно, стоимость лечения, что особенно важно для регионов, где остро стоит проблема недостатка финансовых средств и опытного персонала.

Подбор и изменение схем лечения пациентов с ВИЧ и СПИД с целью поддержания супрессии вируса в организме – достаточно сложная задача. Сейчас доступно примерно 25 видов лекарств против ВИЧ, из которых врач обычно выбирает комбинацию из 3 более. Однако, мутации, возникающие в геноме вируса, делают его устойчивым к определенным лекарствам, и в этом случае врачу часто приходится перебирать несколько комбинаций, каждый раз опытным путем определяя, к какой из них вирус будет чувствителен.

Компьютерная модель, лежащая в основе HIV-TRePS, использует в своих предсказаниях более 80 различных переменных, включая мутации вирусного генома, лекарства, использованные ранее для лечения пациента, количество CD4-клеток (клеток, которые атакует ВИЧ) и количество вируса в крови. Модель высчитывает для каждой комбинации лекарств вероятность того, что количество вируса в крови будет снижено до величины ниже предела определения (50 копий РНК ВИЧ на 1 мл). Точность предсказания системы оценивается в 80%. Это выше, чем у используемого сейчас метода генотипирования.

В настоящее время исследователи из RDI работают над упрощенной версией системы HIV-TRePS, предназначенной для случаев, когда врач не имеет достаточно полной информации о пациенте, а также планируют создать аналогичные системы для предсказания реакции пациентов на лечение других заболеваний с возможностью развития множественной лекарственной устойчивости, например, гепатита.